葉綠素a本身對(duì)環(huán)境沒(méi)有危害，但它是估算浮游植物生物量的重要指標(biāo)，可以通過(guò)測(cè)定水中浮游植物葉綠素a的含量，掌握水體的初級(jí)生產(chǎn)力情況和富營(yíng)養(yǎng)化水平，在環(huán)境監(jiān)測(cè)中，葉綠素a含量是評(píng)價(jià)水體富營(yíng)養(yǎng)化的指標(biāo)之一。

中國(guó)環(huán)境科學(xué)研究院李子成在《中國(guó)湖庫(kù)營(yíng)養(yǎng)現(xiàn)狀調(diào)查分析》中對(duì)湖泊、水庫(kù)的營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)進(jìn)行了分級(jí)：

比較國(guó)內(nèi)外標(biāo)準(zhǔn)中葉綠素a測(cè)定的關(guān)鍵步驟在于：提取試劑、濾膜類型、樣品保存方法、是否研磨機(jī)研磨后是否需要浸泡、計(jì)算方法。

1.提取試劑

除熱乙醇法，國(guó)內(nèi)外標(biāo)準(zhǔn)方法均采用90%丙酮作為提取試劑。EPA446.0指出，90%丙酮溶液可以有效提取大部分藻類細(xì)胞中的葉綠素a，而且不產(chǎn)生其他衍生物。丙酮是國(guó)際上較為公認(rèn)的提取葉綠素的試劑

2.濾膜

除《水和廢水檢測(cè)分析方法（第四版）》采用乙酸纖維濾膜外，均采用玻璃纖維濾膜。

3.樣品保存方法

樣品的保存條件各種方法略有不同，但水樣采集后均保證4℃冷藏保存，樣品濾膜可冷凍保存。而且葉綠素a測(cè)定樣品濾膜冷凍后再研磨，可提高提取效率。暨南大學(xué)水生生物研究所的林少君在《浮游植物中葉綠素a提取方法的比較與改進(jìn)》的研究結(jié)果。如采樣后不立刻測(cè)定，-18℃下冰凍，再于室溫條件下融解，利用細(xì)胞內(nèi)冰粒的形成和細(xì)胞液濃度的增高引起溶漲，使胞壁結(jié)構(gòu)破碎引起葉綠素溶出。

4.是否研磨及研磨后是否需要浸泡

雖然研磨的方法較為費(fèi)力，但是該方法操作簡(jiǎn)單，儀器設(shè)備要求低，常溫操作不會(huì)對(duì)葉綠素a造成破壞，細(xì)胞破碎完全，對(duì)葉綠素的提取速度快，效率高，并在環(huán)境監(jiān)測(cè)系統(tǒng)廣泛應(yīng)用，考慮到方法的經(jīng)典性和數(shù)據(jù)的可沿用性，新的技術(shù)線路中關(guān)于對(duì)葉綠素a的提取步驟沿用《水和廢水監(jiān)測(cè)分析方法（第四版）》中的研磨方法，研磨提取葉綠素a，主要通過(guò)機(jī)械作用破壞藻類的細(xì)胞壁和葉綠體使葉綠素a溶解于丙酮，并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)。

5.計(jì)算公式及波長(zhǎng)

關(guān)于計(jì)算方法，主要有三色法和單色法，三色法主要考慮了葉綠素b和葉綠素c對(duì)測(cè)定的干擾，測(cè)定的是表觀葉綠素a的含量（包括葉綠素a與脫鎂葉綠素a之和），單色法考慮脫鎂葉綠素a的干擾。從方法的簡(jiǎn)便性來(lái)說(shuō)，三色法操作簡(jiǎn)單，產(chǎn)生誤差幾率小，耗時(shí)比單色法短；目前《水和廢水監(jiān)測(cè)分析方法（第四版）》中測(cè)定葉綠素a的方法在地表水環(huán)境監(jiān)測(cè)中應(yīng)用最為廣泛，該方法采用丙酮研磨提取葉綠素a，用三色法計(jì)算葉綠素a的濃度。